Aplicación de métodos epidemiológicos y filogenéticos en el estudio del virus del dengue en el ecuador: 2009-2014

Abstract

Se realizó un análisis retrospectivo de las infecciones del dengue y un análisis de filogenia del virus con cepas aisladas de muestras clínicas en Ecuador. El objetivo del estudio fue asociar la presencia de los genotipos circulantes de cada serotipo con los casos epidemiológicos reportados, mediante métodos bayesianos de evolución molecular y de estadística inferencial y descriptiva. Se consideraron también factores climáticos y grupos de riesgo. Para la parte epidemiológica se realizó una recopilación de las bases de datos del MSP y del INHAMI con el fin de registrar los datos de número de casos de dengue por provincias y los datos de temperatura media y precipitaciones anuales. Se realizó mediante el software statgraphics Centurion un análisis de varianza y correlación entre los factores climáticos y los casos reportados de dengue anualmente donde sólo la temperatura reEl análisis filogenético del virus del dengue realizado con cepas de Ecuador (2009- 2014) muestra que ha circulado un genotipo por cada serotipo.sultó estadísticamente significativa. Siendo el genotipo Americano/Africano del Denv-1 el de mayor variación genética y el más relacionados con los brotes epidemiológicos (2009,2010 y 2012) registrado en varios provincias (Esmeraldas, Los Ríos y Orellana) de donde surgen aparentes nuevos sublinajes. Una cepa aislada en Manta del genotipo Americano/Asiático del Denv-2, se muestra una posible relación con un gran brote de dengue clásico y hemorrágico jamás reportado en el país, dado en el 2012, ya que diverge del resto de cepas aisladas en Ecuador. Para el caso del DENV-3 las cepas de Ecuador se alinearon dentro del clado del genotipo III y no se vincula con brotes epidemiológicos en nuestro periodo de estudio. El genotipo II del DENV-4 no ha sido reportado con relación a casos fatales del dengue en Latinoamérica, sin embargo, en el Ecuador, este genotipo circulo antes, durante y después de un brote epidemiológico.