Estudios de diversidad genética en caña de azúcar usando marcadores rapds

Abstract

Se caracterizaron molecularmente de 249 accesiones, que corresponden a la segunda mitad del Banco de Germoplasma del CINCAE, utilizando la técnica molecular AP-RAPDs. Esta técnica combina el uso de un iniciador arbitrario con la síntesis enzimática de múltiples copias de ADN. Veinte y nueve iniciadores de la serie OPERON Technologies generaron un total de 154 bandas polimórficas en un rango de 500-3900 pb. El número promedio de bandas amplificadas por iniciador es equivalente a 5.3 fragmentos/iniciador y el número de fragmentos polimórficos amplificados va de 3 a 10 por iniciador. El porcentaje de polimorfismo calculado en relación al número de bandas amplificadas y polimórficas es de 37.29%. Los Coeficientes de Similitud Genética fueron obtenidos por medio del programa NTSYSpc, opción Jaccard y a partir del método algorítmico UPGMA incluido en el programa se generó un dendograma, donde se identificaron 20 grupos distintivos y 33% de las variedades no se agruparon de manera definida. El promedio de similitud de los genotipos es del 65.5%. La variedad con mayor superficie cultivada en el Ecuador, Ragnar, se encuentra en el grupo 14, al igual que las variedades CP33-224 y CP52-43 reportadas en la literatura por su alto contenido de sacarosa.