Resumen:
El virus de la necrosis hipodérmica y hematopoyética infecciosa (IHHNV) está asociado con crecimiento retardado y deformidades en camarones Penaeus (Litopenaeus) vannamei. El presente trabajo tuvo como objetivo obtener información de línea base sobre prevalencia y diversidad genética de las cepas de IHHNV circulando en Ecuador, y compararla con las secuencias y aislados virales de otras localidades geográficas. Las relaciones evolutivas de los aislados virales obtenidos en este estudio y 24 secuencias originarias de otros países productores de camarón fueron inferidas con el método discreto de máxima verosimilitud, usando el modelo de sustitución de nucleótidos de 2 parámetros de kimura, como mejor ajuste de evolución molecular. El árbol filogenético mostró diferentes grupos de secuencias, diferenciando tanto el tipo de cepas (infecciosas versus no infecciosas) y el origen geográfico. Las muestras del Ecuador se ubicaron en un gran grupo de cepas infecciosas, pero presentando una diferenciación entre las cepas originarias del Guayas y las de El Oro, sugiriendo la presencia de genotipos en los aislados virales circulantes en el país. Los resultados encontrados pueden generar información útil para manejo a nivel de camaroneras (desarrollo de técnicas de diagnóstico más sensibles, estudios de correlación entre diversidad genética y virulencia, entre otros).
