Descripción:
El presente estudio aborda la necesidad de entender las interacciones moleculares entre el ácido poliláctico (PLA) y las membranas lipídicas, un aspecto crucial para el desarrollo de aplicaciones biomédicas como implantes, dispositivos médicos y sistemas de liberación de fármacos. El problema central para resolver es la falta de modelos moleculares precisos que permitan simular y analizar estas interacciones en un entorno biológico realista. La comprensión detallada de cómo el PLA interactúa con las membranas celulares puede proporcionar información valiosa sobre su biocompatibilidad y comportamiento en aplicaciones biomédicas. La estrategia aplicada para resolver este problema se basó en el uso de herramientas avanzadas de modelado molecular, específicamente Avogadro y CHARMM-GUI. El proceso comenzó con la obtención y optimización de las estructuras iniciales de PLA y membrana lipídica. Se seleccionaron lípidos comunes en membranas biológicas, como POPC, DPPC y colesterol, para construir una membrana representativa. Luego, se integraron estas estructuras utilizando Avogadro, asegurando una correcta conectividad y orientación de la molécula de PLA respecto a la membrana. La ejecución del archivo de entrada en CHARMM se realizó en un entorno controlado, verificando cada paso del proceso. Los archivos resultantes fueron revisados visualmente utilizando VMD y Avogadro para asegurar que la estructura combinada fuera precisa y libre de errores. Además, se comprobaron los parámetros de simulación para garantizar que fueran consistentes con los archivos de topología y parámetros utilizados. Los resultados obtenidos demuestran que la metodología aplicada fue efectiva para integrar y validar la estructura combinada de PLA y membrana lipídica. La revisión visual confirmó la ausencia de solapamientos no deseados y la correcta conectividad entre los átomos. La generación exitosa de los archivos PSF y CRD valida la integridad y precisión del modelo, asegurando que está listo para futuras simulaciones moleculares. 7 Estos resultados permiten avanzar en el estudio detallado de las interacciones moleculares y la biocompatibilidad del PLA, proporcionando una base sólida para investigaciones futuras. este estudio ha desarrollado un modelo molecular integrado y validado de PLA y membrana lipídica, utilizando herramientas avanzadas de modelado molecular y estrategias de validación rigurosas. Los archivos generados están preparados para futuras simulaciones moleculares, proporcionando una plataforma robusta para el análisis de las interacciones moleculares y la biocompatibilidad del PLA en aplicaciones biomédicas