Se diseñó un sistema de cultivo intensivo de biomasa alternativa (microalgas) lo que llamaremos fotobiorreactor, para la producción de biocarburantes con el propósito de reemplazar el diésel proveniente de los combustibles fósiles y las otras fuentes de biodiesel tales como la soya, caña de azúcar, maíz y demás aceites y grasas animales y vegetales. Para determinar la demanda de biodiesel se tomará como referencia el consumo de Diesel promedio que según estudios realizados podrían tener 2 turbinas de una central termoeléctrica de la ciudad de Guayaquil para su arranque. Se está asumiendo un 100% de eficiencia en los procesos que ocurren después del cultivo de la microalga como son la recolección, secado, prensado, obtención de aceite y la posterior transesterificación; es decir la presente tesis sólo abarcará los parámetros fluido dinámicos del sistema de cultivo intensivo basándose en una cantidad calculada de la ecuación de la transesterificación de ácidos grasos.