Resumen:
Ecuador es el mayor exportador de camarón de cultivo Penaeus vannamei en la región
y uno de los más importantes a nivel mundial. Sin embargo, las enfermedades son la
principal limitante de la producción. Actualmente, la enfermedad bacteriana causante
de la necrosis aguda hepatopancreática (AHPND) provoca cuantiosas pérdidas en la
industria camaronera. El objetivo del presente estudio fue caracterizar las comunidades
bacterianas de cultivos larvarios de P. vannamei afectados con la enfermedad de la
necrosis aguda hepatopancreática. Se recolectó muestras de 64 tanques de un
laboratorio comercial que fue afectado naturalmente por bacterias causantes de
AHPND. Las muestras que fueron confirmadas por PCR o histopatología se sometieron
al análisis de la microbiota mediante la secuenciación de la región V3-V4 del 16S
rRNA. Luego del diagnóstico PCR, los genes de toxina pirABVP fueron detectados en
57 de 64 tanques. El análisis bioinformático identificó alrededor de 8626 ASVs en el
total de las muestras. El índice de Simpson determinó diferencias significativas entre
los estadíos provenientes de tanques saludables. El análisis de similaridad (ANOSIM)
de beta diversidad determinó diferencias significativas entre los tanques sanos y
afectados por AHPND. El análisis discriminante lineal (LEfSe) y metagenomeSeq
determinaron que los géneros Alteromonas, Pseudoalteromonas, Mameliella, Yangia y
Pontibacterium son biomarcadores de salud, mientras que Gilvibacter,
Cyclobacterium, Neptunomonas, Haliea fueron biomarcadores de AHPND. Este
estudio proporciona información de secuencias de bacterias que fueron
significativamente abundantes en larvas sanas y podrían ser usadas como potenciales
probióticos contra AHPND.
