En Ecuador, la participación de mujeres científicas es del 41%, mientras que para América Latina y el Caribe es del 45%. La representación femenina en STEM ha incrementado con el pasar de los años; no obstante, sus ingresos en estas áreas son un 20% menos que sus homólogos masculinos. Se han realizado investigaciones del mercado laboral ecuatoriano, sin embargo, este estudio propone explicar la representación laboral femenina y la brecha salarial en los grupos de ocupación STEM. Se tomaron datos de la ENEMDU correspondientes a los periodos 2018 y 2019 usando los modelos econométricos Probit, MCO y la descomposición Blinder-Oaxaca en el que se obtuvo que factores como el estado civil, la presencia de hijos menores a 6 años y características demográficas, influyen directamente en la probabilidad que una mujer pueda aumentar su ingreso y de obtener un empleo o subempleo en STEM. Además, se comprobó que la brecha salarial en los grupos de ocupaciones STEM puede ser en su mayoría explicada por características observadas, mientras que el restante se le atribuye a la discriminación de género. Finalmente, se concluyó que las mujeres se concentran en grupos de ocupación STEM en los que se perciben menores sueldos.