Las industrias manufactureras ecuatorianas son generadoras de ingresos, producción y empleo, por lo cual este estudio se plantea analizar la productividad del sector, aplicando estimaciones con la función de Cobb Douglas, considerando: ingreso, materias primas, capital y empleo con la finalidad de medir el impacto del Impuesto a la Renta en la variación de dicha productividad en las distintas empresas de la industria dentro del periodo 2014 ? 2021. La metodología aplicada tiene un enfoque cuantitativo y para ello se utilizó el software STATA v.26, útil para la estimación del modelo dinámico Generalizado de Momentos que ayudó a minimizar los problemas de simultaneidad, endogeneidad y heterogeneidad no observada, y así determinar de manera más confiable la productividad total de los factores (PTF) y posterior el impacto del impuesto sobre la variación de la productividad mediante un modelo de efectos aleatorios. Se concluyó que, el insumo que mejor aporta a la productividad empresarial es el consumo de materias primas y se encontró evidencia estadística a favor de una relación negativa entre la PTF y el impuesto a la renta, en especial para las empresas grandes y pequeñas, así como para las empresas fabricantes de metal, papel o alimentos. Palabras claves: Productividad total de factores; Impuesto a la renta; heterogeneidad; variación.