Variabilidad genética del gen E6, virus del papiloma humano genotipo 16 en muestras aisladas en el Ecuador

Abstract

El Papiloma Humano es ocasionado por los Papillomavirus, siendo estos responsables de cáncer cervico uterino (CCU), uno de los canceres con mayor incidencia en el mundo, la enfermedad también es llamada Virus del Papiloma Humano o VPH. Para el presente estudio se analizo la secuencia E6 del genotipo 16, este genotipo de VPH esta catalogado como de alto riesgo en producir CCU. El gen E6 es uno de los genes mas utilizados en la parte filogenética, siendo asi que se lo utiliza junto LCR para su separación por linajes y junto al E7 para observar el nivel oncogénico de las muestras. En el estudio se utilizaron iniciadores específicos para el gen E6, dando un amplicón de 220bp, estos iniciadores fueron diseñados en el laboratorio del Instituto Nacional de Salud Pública e Investigación del Ecuador. Se utilizaron un total de 15 muestras y al paso de la metodología se pudieron analizar 7 muestras las cuales presentaron un alto nivel de cromatograma en su secuenciación. En el análisis filogenético se utilizo el programa BEAST 1.8.4 con el modelo Neighbor-joining y el parámetro de Jukes Cantor (el parámetro se escogio por un estudio previo que se lo realizo en el programa MEGA 5.2) Dando asi como resultado los linajes circundantes en el país que son el linaje Africano (28%), Europeo (28%) y Asiático Americano (44%) siendo el ultimo con mayor incidencia por la muestras analizadas. El linaje Asiático Americano tiene una mayor nivel oncogénico en relación a los otros linajes del mismo genotipo, esto es una alerta para el Ministerio de Salud Pública ya que existirán nuevos casos de cáncer en el país y como la enfermedad del VPH es asintomático se convierte en un mayor problema. Con este estudio se busca observar la variabilidad genética presente en el país para así tener en cuenta como va mutando la enfermedad y cuales son los linajes con mayor predominancia.