Ocurrencia y variabilidad genética de strawberry necrotic shock virus (SNSV) en mora  (Rubus glaucus) en Ecuador

Brito Coox, María Lourdes

dc.contributor.advisor	Quito Avila, Diego Fernando, Director
dc.contributor.author	Brito Coox, María Lourdes
dc.creator	ESPOL.FCV
dc.date.accessioned	2024-11-12T16:13:36Z
dc.date.available	2024-11-12T16:13:36Z
dc.date.issued	2024
dc.identifier.citation	Brito Coox, M. L. (2024). Ocurrencia y variabilidad genética de strawberry necrotic shock virus (SNSV) en mora (Rubus glaucus) en Ecuador. [Proyecto Integrador]. ESPOL.FCV .
dc.identifier.uri	http://www.dspace.espol.edu.ec/handle/123456789/62425
dc.description	El cultivo de mora (Rubus glaucus Benth) en la Sierra ecuatoriana, crucial para más de 12 mil productores, enfrenta desafíos por enfermedades virales como el strawberry necrotic shock virus (SNSV), un patógeno no reportado previamente en el país. La falta de programas de certificación fitosanitaria para material vegetal en Ecuador agrava la propagación de enfermedades. Este estudio busca determinar la ocurrencia y la variabilidad genética del virus strawberry necrotic shock virus (SNSV) a partir de material vegetal infectado de la región Sierra de Ecuador para la implementación de medidas de manejo. Para ello se utilizaron muestras de mora y frutilla de las provincias de Tungurahua, Azuay y Pichincha y se emplearon técnicas moleculares como HTS y RT-PCR, y análisis bioinformáticos para evaluar la diversidad genética de la cápside del virus. Los resultados mostraron que SNSV no presenta variantes recombinantes y que las secuencias ecuatorianas están estrechamente relacionadas con las secuencias estadounidenses (AY363238, AY363240, AY363241) con identidades de nucleótidos altas. SNSV parece estar limitado a la mora en Tungurahua, con una incidencia creciente en los últimos años. Estos hallazgos subrayan la necesidad de establecer medidas de manejo y programas de certificación para asegurar material de propagación libre de virus. Palabras Clave: certificación fitosanitaria, diversidad genética, propagación vegetativa, recombinación genética
dc.format	application/pdf
dc.format.extent	46 página
dc.language.iso	spa
dc.publisher	ESPOL.FCV
dc.rights	openAccess
dc.subject	Certificación fitosanitaria
dc.subject	Diversidad genética
dc.subject	Propagación vegetativa
dc.subject	Recombinación genética
dc.title	Ocurrencia y variabilidad genética de strawberry necrotic shock virus (SNSV) en mora (Rubus glaucus) en Ecuador
dc.type	Biólogo
dc.identifier.codigoespol	T-114388
dc.description.city	Guayaquil
dc.description.degree	Escuela Superior Politécnica del Litoral
dc.identifier.codigoproyectointegrador	VIDA-359
dc.description.abstractenglish	The blackberry crop (Rubus glaucus Benth) in the Ecuadorian Sierra, crucial for more than 12 thousand producers, faces challenges due to viral diseases such as strawberry necrotic shock virus (SNSV), a pathogen not previously reported in the country. The lack of phytosanitary certification programs for plant material in Ecuador aggravates the spread of diseases. This study seeks to determine the occurrence and genetic variability of strawberry necrotic shock virus (SNSV) from infected plant material from the Sierra region of Ecuador for the implementation of management measures. For this, blackberry and strawberry samples from the provinces of Tungurahua, Azuay and Pichincha were used and molecular techniques such as HTS and RT-PCR, and bioinformatic analyzes were used to evaluate the genetic diversity of the virus capsid. The results showed that SNSV does not present recombinant variants and that the Ecuadorian sequences are closely related to the American sequences (AY363238, AY363240, AY363241) with high nucleotide identities. SNSV appears to be limited to defaults in Tungurahua, with an increasing incidence in recent years. These findings underscore the need to establish management measures and certification programs to ensure virus-free propagation material. Keywords: phytosanitary certification, genetic diversity, vegetative propagation, genetic recombination