Prevalencia de raspberry bushy dwarf virus y rose ilarvirus-2 en Ecuador para la  propagación de plantas de mora

Cifuentes Morales, Raul Bolívar

dc.contributor.advisor	Quito Avila, Diego Fernando, Director
dc.contributor.author	Cifuentes Morales, Raul Bolívar
dc.creator	ESPOL.FCV
dc.date.accessioned	2024-11-12T16:32:05Z
dc.date.available	2024-11-12T16:32:05Z
dc.date.issued	2024
dc.identifier.citation	Cifuentes Morales, R. B. (2024). Prevalencia de raspberry bushy dwarf virus y rose ilarvirus-2 en Ecuador para la propagación de plantas de mora. [Proyecto Integrador]. ESPOL.FCV .
dc.identifier.uri	http://www.dspace.espol.edu.ec/handle/123456789/62426
dc.description	Se tuvo como objetivo de este estudio determinar la prevalencia y variabilidad genética de Raspberry bushy dwarf virus (RBDV) y Rose ilarvirus-2 (RIV-2) en cultivos de mora andina (Rubus glaucus) en Ecuador. La problemática radica en la propagación de estos virus, que afectan negativamente el rendimiento y la calidad del fruto, amenazando la producción sostenible. Se abordaron como preguntas de investigación el cómo estos virus impactan los cultivos y qué medidas pueden implementarse para su control. Se recolectaron muestras de hojas en diferentes años (2017, 2018, 2023) en las provincias de Tungurahua y Pichincha, y se analizaron utilizando secuenciación de alto rendimiento (HTS), RT-PCR y secuenciación Sanger. Los resultados muestran una alta prevalencia de RBDV en todas las muestras y una variabilidad genética limitada entre los aislados ecuatorianos, sugiriendo una población viral estable. Sin embargo, también se detectaron eventos de recombinación en RBDV, lo que podría implicar una mayor capacidad de evolución. La coinfección con RIV-2 también fue significativa, lo que indica la necesidad de protocolos de diagnóstico más robustos. Los análisis filogenéticos y de recombinación permitieron identificar la prevalencia de RBDV y la primera detección de RIV-2 en Ecuador. Como conclusión, se recomienda implementar programas nacionales de monitoreo y control de virus en viveros, además de ampliar el estudio para incluir más regiones y analizar el impacto de factores ambientales en la evolución viral. Esto contribuiría a mejorar la sostenibilidad de la producción de mora andina en Ecuador
dc.format	application/pdf
dc.format.extent	35 página
dc.language.iso	spa
dc.publisher	ESPOL.FCV
dc.rights	openAccess
dc.subject	Virus en viveros
dc.subject	Producción de mora andina en Ecuador
dc.subject	Los análisis filogenéticos
dc.subject	Variabilidad genética
dc.title	Prevalencia de raspberry bushy dwarf virus y rose ilarvirus-2 en Ecuador para la propagación de plantas de mora
dc.type	Biólogo
dc.identifier.codigoespol	T-114389
dc.description.city	Guayaquil
dc.description.degree	Escuela Superior Politécnica del Litoral
dc.identifier.codigoproyectointegrador	VIDA-360
dc.description.abstractenglish	The objective of this study was to determine the prevalence and genetic variability of Raspberry bushy dwarf virus (RBDV) and Rose ilarvirus-2 (RIV-2) in Andean blackberry (Rubus glaucus) crops in Ecuador. The issue lies in the spread of these viruses, which negatively a]ect fruit yield and quality, threatening sustainable production. The research questions addressed how these viruses impact crops and what measures can be implemented for their control. Leaf samples were collected in di]erent years (2017, 2018, 2023) from the provinces of Tungurahua and Pichincha and analyzed using high-throughput sequencing (HTS), RT PCR, and Sanger sequencing. The results show a high prevalence of RBDV in all samples and limited genetic variability among the Ecuadorian isolates, suggesting a stable viral population. However, recombination events in RBDV were also detected, which could imply a greater evolutionary capacity. The coinfection with RIV-2 was also significant, indicating the need for more robust diagnostic protocols. Phylogenetic and recombination analyses identified the prevalence of RBDV and the first detection of RIV-2 in Ecuador. In conclusion, it is recommended to implement national virus monitoring and control programs in nurseries, in addition to expanding the study to include more regions and analyze the impact of environmental factors on viral evolution. This would contribute to improving the sustainability of Andean blackberry production in Ecuad