Abstract:
The rice hoja blanca virus (RHBV) represents one of the main phytosanitary threats to rice production in Ecuador, affecting both crop yield and quality. This project aimed to develop a molecular diagnostic protocol for RHBV and to analyze its genetic variability as well as its geographic distribution, in response to the increasing presence of the insect vector responsible for its transmission. The study was conducted through the collection of leaf samples, RNA extraction, amplification of specific viral fragments by RT-PCR, and Sanger sequencing.
The results revealed a heterogeneous distribution of RHBV among the different sampled cantons, as well as low genetic variability between national isolates and international sequences. In conclusion, the diagnostic protocol proved to be efficient due to the amplification of conserved genomic fragments, making it an effective and accurate tool for early detection.
Keywords: molecular diagnosis, RT-PCR, phylogeny, rice.
Description:
El virus de la hoja blanca del arroz (RHBV) representa una de las principales amenazas fitosanitarias para la producción arrocera del Ecuador, afectando el rendimiento y la calidad del cultivo. El presente proyecto tuvo como objetivo realizar un protocolo de diagnóstico molecular para el RHBV y analizar su variabilidad genética al igual que su distribución geográfica, en respuesta a la creciente presencia del insecto vector responsable de su transmisión. El estudio se desarrolló mediante la recolección de muestras foliares, extracción de ARN, amplificación de fragmentos específicos del virus por medio de RT-PCR y secuenciación Sanger.
Los resultados evidenciaron una distribución heterogénea del RHBV entre los diferentes cantones muestreados, así como una baja variabilidad genética entre los aislados nacionales y las secuencias internacionales. En conclusión, el protocolo de diagnóstico resulto ser eficiente debido a su amplificación por los fragmentos genómicos conservados, siendo una herramienta eficaz y precisa para su detección temprana.
