Abstract:
Banana production in Ecuador confronts significant phytosanitary challenges, with Banana streak virus (BSV), genus Badnavirus, representing a latent threat. This project assessed the incidence and genetic diversity of the pathogen across Guayas and Los Ríos provinces to strengthen local diagnostic capabilities. Throughout the study, foliar and reproductive tissues were collected via targeted sampling, prioritizing plants exhibiting characteristic symptomatology. Nucleic acid extraction protocols were optimized, and endpoint PCR assays targeting capsid and polyprotein regions were performed, followed by Sanger sequencing and phylogenetic analysis. Findings confirmed viral presence in Guayas localities such as Tenguel and Salitre, specifically identifying Banana streak OL virus (BSOLV) through alignments, demonstrating high homology with reference sequences. Furthermore, viral amplification was validated in fruit peel tissue, corroborating the systemic nature of the virus. It is concluded that BSOLV is prevalent in Ecuador, and the standardized molecular tool ensures robust detection, which is critical for crop health monitoring and the prevention of viral dissemination.
Keywords: Badnavirus, Molecular diagnosis, Musa spp., PCR, Phylogeny.
Description:
La producción bananera de Ecuador enfrenta desafíos fitosanitarios significativos, siendo el Banana streak virus (BSV), género Badnavirus, una amenaza latente. Este proyecto evalúa la incidencia y diversidad genética del patógeno en las provincias de Guayas y Los Ríos para fortalecer el diagnóstico local. Durante el desarrollo se recolectaron tejidos foliares y reproductivos mediante un muestreo dirigido primordialmente a plantas con sintomatología característica. Se optimizaron protocolos de extracción de ácidos nucleicos y se ejecutaron ensayos de PCR de punto final dirigidos a regiones de la cápside y poliproteínas, complementados con secuenciación Sanger y análisis filogenético. Los resultados demostraron la presencia del virus en localidades del Guayas como San Lorenzo de Garaicoa, Tenguel y Salitre. Se identificó al Banana Streak OL virus (BSOLV) mediante alineamientos que revelaron alta homología con secuencias de referencia. Asimismo, se validó la amplificación viral en cáscara de fruto, confirmando la naturaleza sistémica de la infección. Se concluye que BSOLV prevalece en el Ecuador y que la herramienta molecular estandarizada garantiza una detección robusta, fundamental para el monitoreo de la salud del cultivo y la prevención de la dispersión viral
