Generación de marcadores moleculares en tomate de árbol (solanum betaceum cav. sin cyphomandra betacea sendt.) para estudios de diversidad genética de germoplasma ecuatoriano

Abstract

Ecuador dispone de alta variabilidad genética sub utilizada o no utilizada pero con gran importancia nacional e internacional por ser fuente de alimentos principalmente; este material amerita ser estudiado, mejorado y proyectado al desarrollo nacional, por eso se buscó introducir técnicas de genotipeado como herramienta de apoyo al desarrollo de variedades económicamente importantes. Se utilizaron 30000 secuencias de EST de papa (S. tuberosum) de los bancos de datos DEL GeneBanck del NCBI, mediante el programa SSr primer se encontraron las secuencias no redundantes, se determinó si estas secuencias codifican a proteínas mediana el programa BLAST y a partir de esta información se diseñaron 200 primeros o iniciadores para probar su anclaje o amplificación en 9 entradas o líneas de tomate de árbol. Se obtuvieron 34 microsatelites, de los cuales 22 presentaron amplificación monomórfica y 12 polimórfica, 14 loci fueron identificados en este estudio. Los resultados mostraron que el 3,4% de los primeros sintetizados presenta amplificación en el ADN de tomate de árbol.